中国农业科学院柑桔研究所学科建设截至2009年9月，中国农业科学院柑桔研究所有3个二级学科博士点，9个二级学科硕士点，2个博士后流动站
博士学位授权点（3个）：植物病理学（二级学科）、果树学（二级学科）、农产品加工与贮藏工程（二级学科） 硕士学位授权点（9个）：植物病理学（二级学科）、作物遗传育种学（二级学科）、作物种质资源学（二级学科）、果树学（二级学科）、农产品加工与贮藏工程（二级学科）、土壤学（二级学科）、微生物学（二级学科）、植物学（二级学科）、细胞生物学（二级学科） 博士后流动站（2个）：园艺学博士后流动站、植物保护博士后流动站
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