中国农业科学院哈尔滨兽医研究所科研部门截至2020年9月17日，中国农业科学院哈尔滨兽医研究所拥有中国唯一的大动物生物安全四级设施——“国家动物疫病防控高级别生物安全实验室”；所辖实验室分别被指定为国家禽流感参考实验室、国家非洲猪瘟专业实验室、国家马传染性贫血参考实验室、国家马鼻疽参考实验室、国家牛肺疫参考实验室，以及联合国粮农组织（FAO）动物流感参考中心、世界动物卫生组织（OIE）禽流感参考实验室、OIE马传贫参考实验室和OIE鸡传染性法氏囊病参考实验室及OIE亚太区人兽共患病区域协作中心；下辖全资哈尔滨维科生物技术有限公司和合资控股动物用生物制品国家工程研究中心
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