中国农业科学院深圳农业基因组研究所科研部门截至2017年5月，研究所建设了1个农业部重点实验室，1个深圳市重点实验室，建设了深圳中农京跃生物技术有限公司、 国家农业基因组科技创新联盟
农业部重点实验室：农业基因数据分析重点实验室深圳市重点实验室：农业基因组表型分析与利用重点实验室
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