中国农业科学院农业质量标准与检测技术研究所研究部门截至2014年10月，质标所拥有1个国家质量监督检验中心、1个农业部重点实验室、1个中国农业科学院重点实验室，设有7个研究室；是WTO/TBT-SPS国家通报咨询中心农业部联系点、国家农产品质量安全风险评估专家委员会办公室和中国国际食品法典委员会（CAC）农业分析方法专家工作组的挂靠单位，是农业部农药登记残留试验单位
国家质量监督检验中心：国家饲料质量监督检验中心（北京）农业部重点实验室：农业部农产品质量安全重点实验室中国农业科学院重点实验室：中国农业科学院农产品质量与食物安全重点实验室研究室：政策研究室、信息研究室、风险分析研究室、残留检测研究室、农产品质量安全研究室、农业标准研究室、饲料质量安全研究室
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