中国科学院成都生物研究所科研部门截至2014年底，中国科学院成都生物研究所设有5个所级研究机构，是国家天然药物工程技术研究中心、中国科学院山地生态恢复与生物资源利用重点实验室、中国科学院环境与应用微生物重点实验室、中国科学院四川转化医学研究医院的依托单位
所级研究机构：天然药物与转化医学重点实验室、生态研究中心、应用与环境微生物研究中心、农业生物技术研究中心和两栖爬行动物研究室
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