中国医学科学院医学实验动物研究所动物资源特种动物据2019年4月研究所官网资料显示，研究所建立了无菌兔、无菌小鼠、悉生兔、悉生小鼠的生产群，已形成年供应1000只悉生动物的能力

制备两个品系的无菌小鼠120只，无菌兔5批20只，无菌豚鼠50批70只，无菌大鼠20批225只形成一定规模生产种群 

基因工程动物据2019年4月研究所官网资料显示，研究所已经建立和社会共享的心脏病、高血压、痴呆症、帕金森症等基因工程模型500多种

每年为100个以上的实验室提供基因工程动物资源

是国家主要的基因工程动物品系资源研制和供应基地之一

模型分类数量模型分类数量工具基因工程小鼠63microRNA转基因小鼠6神经系统相关基因工程小鼠74其他小鼠47心脏病和高血压相关基因工程小鼠60口腔疾病模型1代谢相关基因工程模型34介素31信号传导相关基因工程模型22大鼠品系60免疫、传染病相关基因工程模型90衰老相关疾病研究小鼠4肿瘤相关模型62总计503 动物模型据2019年4月研究所官网资料显示，研究所拥有传染病、药物诱导和手术动物模型约170余种，是中国唯一的人类疾病模型动物资源研制和供应基地

每年为200个以上机构提供疾病模型创制服务

建立了一些用于治疗和预防重大传染性疾病的药物和疫苗研发所需要的动物模型，包括艾滋病动物模型、SARS动物模型、高致病性禽流感动物模型、肝炎动物模型等，其中SARS非人灵长类动物模型得到世界卫生组织（WHO）的认可

种类数量种类数量神经系统疾病模型9感染性疾病模型手足口病动物模型5心血管疾病模型9高致病性流感模型8肿瘤标记物模型51SARS模型3代谢性疾病模型7结核模型8皮肤疾病模型2艾滋病模型21口腔疾病模型1肝炎模型4早衰小鼠模型1新中东冠状病毒模型1过敏性疾病模型3手术模型39总计172 

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