中国医学科学院医学信息研究所交流合作积极开展国际科技交流活动，与美国、日本、德国、俄罗斯、香港等国家与地区的生物医学信息机构建立了友好的交流合作关系，开展了共同研究、馆际互借、学习进修、学术交流等多种合作，有力促进了所馆信息事业的发展

认真履行世界卫生组织（WHO）卫生与生物医学信息合作中心职能

所馆承担着为周边国家与地区提供医学信息服务的义务，做好医学信息的收集及传播工作；完成与WHO合作项目，结合所馆资源优势和社会需求，围绕医学信息资源建设、开发利用及服务等领域举办业务培训班

不断加强与美国健康基金会的合作

先后开展了“提高医学信息服务培训”和“西部地区卫生管理人员信息利用技能培训”等合作项目，对提高广大医务人员及卫生管理者的医学信息资源检索和利用技能等方面起到了很大的推动作用

巩固和扩大与美国国立医学图书馆（NLM）的交流

作为NLM第16个MEDLARS中心，所馆承担着为NLM中文期刊的文献标引工作

与图书馆和出版社建立稳定的合作关系

所馆每年从香港大学医学图书馆获赠大批生物医学专业书刊；同时与美国Ramtech出版公司、Springer-Verlag出版社、剑桥出版社、Lippincott、 Williams & Wilkins 出版社、Elsevier出版社和McGraw-Hill等多家出版社都建立了稳定的合作关系

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