日本理化学研究所发展史时间本地发展（和光）地域扩展大科学设施1917年3月RIKEN创立1937年建成日本第一个回旋加速器（直径65厘米）1944年建成直径150厘米的回旋加速器（二战结束后被占领军摧毁）1952年建成直径65厘米的回旋加速器1963年3月迁到现址埼玉县（Saitama）和光市（Wako）1966年建成直径160厘米的重离子回旋加速器1980年建成世界上第一个可变频率直线加速器RILAC（RIKEN Heavy-ion Linac）1984年10月在筑波（Tsukuba）研究学园都市设立生命科学筑波研究中心，发展DNA重组技术1986年10月设立先进科学研究所（前沿研究系统）1987年建成RRC重离子环形回旋加速器，RILAC作为注入器1988年10月与日本原子能研究所JAERI成立联合机构负责在京都（Kyoto）建造大型同步辐射装置Spring-81989年建成AVF回旋加速器1990年10月在仙台（Sendai）市设立光动力学研究中心1993年10月在名古屋（Nagoya）设立生物模拟控制研究中心
1995年4月成立RIKEN的RAL分所在英国Rutherford Appleton研究所建造了μ介子科学研究设施1997年10月设立脑科学综合研究中心在播磨（Harima）科学公园都市设立播磨研究所SPring-8开始运行，主要开展生命科学及其交叉领域研究1997年4月在美国布鲁克海文国家实验室（BNL）设立RIKEN的BNL研究中心，重点研究相对论重离子对撞机物理计划、硬量子色动力学/自旋物理、格点量子色动力学和相对论重离子物理RIKEN BNL研究中心的研究重点是相对论重离子对撞机物理计划、硬量子色动力学/自旋物理、格点量子色动力学和相对论重离子物理
1998年10月设立基因组科学综合研究中心2000年4月生命科学筑波研究中心改称为筑波研究所，设立植物科学研究中心，设立发生与再生科学综合研究中心，设立基因多型研究中心
设立横滨（Yokohama）研究所横滨研究所由现有的基因组科学综合研究中心、新设的基因变异型研究中心和植物科学研究中心构成，它实际上把该所关于人和植物的基因组、蛋白质以及基因信息科学等最尖端的科学技术研究部门集中在一起
从2000年10月份起，有360多名科学家开始在这里从事关于基因科学的研究活动
2001年设立生物资源研究中心，设立免疫与过敏科学研究中心2002年设立中央研究所设立神户（Kobe）研究所，下设发展生物学综合研究中心和再生医学综合研究中心2003年RIKEN改制为独立行政法人机构建立了跨学科合作研究体制，开拓新的研究领域，开展工业应用的“种子”研究
2004年与产业界联合创建了“融合的联合研究制度”由日本国内企业提出研究开发课题，或公开征集并联合选定新的研究课题，将RIKEN的研发能力与企业的研发能力融合，促进两者在基础和应用阶段的联合
2005年成立知识产权战略中心满足社会需求，加速专利研究成果产业化
2005年7月神户研究所设立传染病研究网络支援中心、放射线科学综合研究中心2006年4月设立仁科（Nishina）加速器研究中心2006年6月在Spring-8成功研制700米长X射线自由电子激光的60米样机2006年建成fRC、IRC、SRC2007年4月在神户建立分子成像研究学院2007年放射性同位素工厂RIBF2008年3月1998年建立的基因组科学综合研究中心关闭2008年4月发现研究所和前沿研究系统相结合，形成先进科学研究所（ASI）SNP研究中心集成到基因组医学中心设立RIKEN-MIT神经回路遗传学中心（CNCG）2008年10月形成分子影像科学中心（CMIS）2010年7月建立先进计算科学研究所2011年4月建立定量生物学中心2023年3月第一台日本国产量子计算机投入使用
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