北京应用物理与计算数学研究所主要研究领域理论物理 粒子物理与原子核物理 等离子体物理 激光物理 流体力学 应用数学 计算数学 计算机应用 军备控制科学技术 　研究所设置有：高技术研究室、计算物理实验室、原子与分子研究室、非线性研究中心等9个研究室以及技术开发公司、科研服务中心、技术保障中心等科研辅助部门

在人才培育方面，研究所设有物理与数学两个博士后流动站

具有物理学和数学两个一级学科博士学位授予权；理论物理、等离子体物理、粒子物理与原子核物理、无线电物理、光学、流体力学、应用数学、计算数学、基础数学九个二级学科博士学位授予权；计算机应用二级学科硕士学位授予权

研究所主办有全国性学术刊物《计算物理》、《计算数学通讯》；是中国原子分子数据研究联合体的主持单位；是全国性学术刊物《偏微分方程》、《中国图像图形学报》的主办单位之一；是全国计算物理学会、北京国际计算物理中心、中国物理学会咨询委员会和原子分子物理专业委员会、中国空气动力学会物理气动力学专业委员会的挂靠单位

几十年来，在全所职工的共同努力下，研究所为国家建设和科学技术的发展做出了重大贡献

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