四川抗菌素工业研究所学科建设根据2020年9月研究所官网显示，四川抗菌素工业研究所拥有一级学科硕士学位授予点1个，是中国首批硕士学位授权单位之一，其中四川省重点学科1个
2011年，研究所获准设立“博士后创新实践基地”
学术学位授权一级学科硕士点：药学学术学位授权二级学科硕士点：药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学 四川省重点学科：微生物与生化药学
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