深圳华大基因研究院研究成果SOAPSOAP是生物信息中心核心技术开发团队自主开发的基因组序列分析的软件包，它可以高效地处理第二代测序技术产出的巨大数量的短序列，并完成其参考序列的定位上，短序列的组装以及序列差异分析等
CAT被称为CAT（跨物种比对工具）的一种新算法，是用来进行mRNA序列与哺乳动物基因组之间的比对
ReASReAS旨在用未集结reads的全基因组鸟枪法恢复转座子的祖先序列
RePSRePS（repeat-masked Phrap with scaffolding）一个从鸟枪数据明确列出具体kmer重复序列，并在组装前删除它们的WGS序列组装方法
所建立的软件Phrap用于为每个 base计算有意义的错误概率
克隆端配对信息用于构建scaffolds的秩序和重叠
更新版的RePS结合了一些用Phusion介绍聚类的想法
数据库BGI有一支专业的团队致力于数据库建设和基于Web应用开发
为了使华大基因提供的数据更好地被理解和使用，我们设立了项目介绍、基因组浏览、数据下载和相关问题等网站
我们也提供典型的基因组分析服务和相关工具的下载服务
教育被誉为20世纪的生命科学阿波罗计划的人类基因组计划开辟了生命科学的新篇章
从2000年完成第一个人类基因组图谱以来，在短短不到十年的时间内，基因组的技术和科学取得了巨大进展，除了更多更为精确的人类和各种种类的生物体基因组图谱得以解析，而且基因组科学研究的技术本身也得到跨越式的发展，新的、更高通量，更低成本的测序技术和更为高效和精确的分析计算技术使得基因组科学迅速渗透到生命科学的各个领域，并已开始迈向实用阶段，成为迎头而来的转化医学，以及农业和工业生物技术的支撑技术
基因组科学所产生的巨大的生物信息数据使得生命科学进入一个以基因组为基础的数字医学或数字生命科学时代，并将成为21世纪生命科学的主流技术领域
高效整理、分析、挖掘测序得到的海量基因组数据，解析生命现象，回答科学问题和提供应用基础是基因组科学，乃至整个数字生命科学的面临的最大挑战，并具有多学科交叉综合的特点，需要包括数理、计算机、软件和生物科学的交叉配合
然而，现行的教育体系和模式难以快速培养适合这一重要发展领域的人才，需要一种结合现实和未来实际需求的复合型学科人才的培养模式和体系
华大基因研究院经过多年的探索和实践，通过与多家拔尖大学合作已经探索出一套完整的本科生，特别是低年级本科生新型生命科学前沿人才培养的体系，开创了一套以大科学问题为切入点的边研究、边学习的“以任务带学科、带产业、带人才”—华大基因研究院全新和独特前沿人才培养模式，并取得了显著的成就
培养目标就是以一种全新的教育理念和模式培养适合未来生命科学前沿发展，以及新兴生物技术产业的拔尖人才
在过去十年间，在华大基因研究院，一大批本科学生通过这一体系的培养迅速成为具备掌握跟踪前沿发展，掌握先进技术，并具备实战经历和能力的优秀生命科学复合型人才，走上重要的工作岗位，做出在Nature、Science等知名科学杂志上发表论文的出色成就
在此基础上， 们已与华南理工大学等知名院校建立了低年级（2年级）至高年级（4年级）2+2本科培养体系，以及完善的高年级毕业实习体系
每年通过选拔吸引包括生命科学专业、计算机专业、软件专业和数理专业的优秀本科生进入这一培养体系
经过2年的建设和完善，深圳华大基因研究院具备了更为完善的学习和实习条件，因此决定在国内拔尖院校中扩大本科生创新班和创新实习的规模，并且与后期华大-哥本哈根大学、华大-香港中文大学博士生攻读计划相衔接，为华大基因研究院和基因组和数字医学/生物学领域提供“实用型和未来型”的顶尖后备人才做出贡献
培训2010年12月人类（健康）篇专题研讨班上海地区生物信息学研讨班2010年10月经典论文回顾系列之水稻（植物）篇专题研讨班纪念华大十一周年 经典论文回顾系列2010年8月生物信息学前沿技术专题班2010年7月生物信息学统计算法暑期班（北京）2010年 美国国家综合进化研究院NEScent·BGI联合系统发育暑期班2010年广州地区专场培训班2010年7月生物信息学前沿技术专题班2010年6月表达谱，转录组专题班2010年5月台湾学者研讨班 （已结束）2010年5月前沿技术培训班生物信息学军科院应用专题培训班 （已结束）2010年首届生物信息学研讨班台湾学者研讨班生物信息学新技术研讨班·复杂疾病方向【生物信息校园系列第一站（第二期）】中国农大·农业方向【生物信息校园系列第二站】----首医大医学方向【十周年特别推荐·深圳】生物信息学前沿技术专题培训班医学继续教育培训班科学普及华大基因自1999年9月9日成立以来，在科学、技术、产业等方面都取得了辉煌的成就，不仅为中国和世界基因组科学的发展做出了突出贡献，更奠定了中国基因组科学在国际上的领先地位
但丰硕成果的背后，华大人不会忘记的是对社会的回馈
为了推动基因组学在青少年群体中的普及和发展，进一步培养和发掘基因科技人才，华大基因一直致力于基因科普工作的推广
深圳华大基因研究院已被深圳市科学技术协会授予为深圳市科普教育基地，随后又挂牌成为北京青少年科技俱乐部学术指导中心
2009年暑假，深圳华大基因研究院与北京青少年科技俱乐部合作，成功举办了高中生“探索生命奥秘”夏令营活动；并与北京大学、武汉大学、华南理工大学等多所全国重点高校合作，举办了大学生“基因组与生物信息学”暑期班活动
活动期间，中央电视台教育频道、深圳电视台等媒体先后进行了跟踪报道，反响热烈
深圳华大基因研究院现已成立科普中心，每年暑假都会定期开办高中生夏令营及本科低年级暑期班活动
科普推广工作也将作为华大的一项长期工作持续推进
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