植物生理学报荣誉表彰《植物生理学报》曾为生物科学类、农作物类和园艺学类的核心期刊；是北京大学图书馆《中文核心期刊要目总览》“植物学类”核心期刊，在2014年版的“植物学类核心期刊表”中排名第6；2015年公布的CJCR引证报告中《植物生理学报》在12种入选的核心期刊中核心总被引频次排名第3（5173次） ，综合评价总分排名第4（48.89分）
1996年，《植物生理学通讯》获上海市优秀科技期刊三等奖
2012年，《植物生理学报》获华东地区优秀期刊
2013年，《植物生理学报》获上海市期刊编校质量检查优秀奖
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