应用与环境生物学报收录情况据2018年3月中国知网显示，《应用与环境生物学报》被CA化学文摘（美）（2014）、JST日本科学技术振兴机构数据库（日）（2013）、Pж（AJ）文摘杂志（俄）（2014）、CSCD中国科学引文数据库来源期刊（2017-2018年度）（含扩展版）、北京大学《中文核心期刊要目总览》来源期刊（2004年版、2008年版、2011年版、2014年版）等收录
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