福建省地质调查研究院机构设置院内部机构设有办公室、党群办公室、财务科、技术科四个管理部门，下设区域地质调查所、矿产地质调查一所、矿产地质调查二所、地质环境调查所、地球物理调查所、地球化学调查所、西藏地质调查所、信息发展中心等八个二级单位
取得区域地质调查、水工环地质勘查、固体矿产勘查、地球物理勘查、地球化学勘查、地质灾害危险性评估和地质灾害治理工程勘查等7个甲级资质，遥感地质勘查乙级资质，勘查工程施工、测绘2个丙级资质；拥有建国以来我省全部基础地质调查、地球物理调查、地球化学调查的原始资料、成果资料和实物资料，是一个专业齐全、功能完备、设备精良、生产与科研紧密结合的地质勘查单位
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