东南大学能源与环境学院办学历史学院能源动力方向最早可溯至东南大学1923年设置的机械工程系的蒸汽动力方向

学院环境方向可溯至1942年设置的卫生组（设置于当时中央大学的土木系）

1954年，由东南大学（时称南京工学院）机械系的热能动力装置专业、电力系的发电厂配电网与联合输电系统专业和工业企业电气化专修科组建动力工程系

1956年，开设工业热工专业

1958年，增设“自动学与远动学”专业

1960年，增设“数字计算技术装置”专业

1962年，上述两个增设的专业从动力系分出成立自动控制系

1969年，以动力系教师为主成立磁流体发电研究工程（6910工程）

1982年，以该工程为基础组建热能工程研究所

1986年，有关电类专业从动力系分出成立电气工程系

1989年，热能工程研究所从动力系分出，行政单列、2001年11月，热能工程研究所与动力工程系重新合并

2006年，在动力工程系的基础上，与土木工程学院的环境工程系合并组建东南大学能源与环境学院，并成立热能工程系、制冷与人工环境工程系、动力工程系、能源信息与自动化系、环境科学与工程系

2009年，依托东南大学能源与环境学院、城市工程科学技术研究院、建筑学院、土木学院及公共卫生学院建立“低碳型建筑环境设备与系统节能”教育部工程研究中心获得教育部批准成立

 2015年4月，依托东南大学太阳能技术研究中心申报的江苏省太阳能技术重点实验室获批立项建设

 2018年10月，省发改委批复同意学院建设“江苏省污泥安全处置与资源化工程研究中心”

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