东南大学自动化学院学科建设学院是国家“985工程”和“211工程”建设重点支持单位
2017年入选国家首批“双一流”建设学科，2022年再次入选“双一流”建设学科名单，在第四轮全国学科评估中获评A类
设有“控制科学与工程”一级学科博士、硕士学位授权点，下设“控制理论与控制工程”、“模式识别与智能系统”、“检测技术与自动化装置”、“导航制导与控制”、“系统工程”等5个二级学科博士、硕士学位授权点，其中“控制理论与控制工程”为国家重点学科，建有“控制科学与工程”一级学科博士后流动站
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