兰州大学大气科学学院合作交流学院十分重视与中国气象局的合作发展，自2002年9月20日，中国气象局与兰州大学正式签署局校合作协议以来，双方进行了全面合作
兰州大学与中国气象局合作共建了“兰州大学大气科学人才培养和科学研究基地”，大气科学学院与国家气候中心签署了“共建兰州大学大气科学一级学科博士点”协议，与中国气象局兰州干旱气象研究所、中国科学院寒区旱区环境与工程研究所共建了“甘肃省干旱气候变化与减灾重点实验室”
同时，与宁夏回族自治区气象局、内蒙古自治区气象局、陕西省气象局、青海省气象局、新疆维吾尔自治区气象局、辽宁省气象局等单位都有良好的合作关系
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