中国热带农业科学院环境与植物保护研究所学科建设截至2010年2月，中国热带农业科学院环境与植物保护研究所共有博士点3个、共有硕士点18个
博士点学术学位授权二级学科（3个）：作物栽培与耕作学、分子植物病理学、农业昆虫与害虫防治专业硕士点学术学位授权一级学科（1个）：生态学硕士点学术学位授权二级学科（17个）：种质资源学、植物营养学、植物学、园林植物与观赏园艺、植物病理学、微生物学、农药学、分子植物病理学、农业昆虫与害虫防治、环境工程、森林保护学、作物遗传育种、农业生物技术、生物化学与分子生物学、能源植物、动物学、植物分子遗传学
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