黑龙江省农业科学院佳木斯分院学院优势科研地位显要进入新世纪以来，分院先后被确立为国家现代农业科技示范园区、国家大豆区域技术创新中心、农业部“合丰号”高油大豆原原种扩繁基地、哈尔滨国家大豆改良分中心合江生态育种室、国家智力引进成果推广基地、黑龙江省大豆灰斑病鉴定中心、黑龙江省农科院博士后科研工作分站、黑龙江省三江平原作物育种与栽培重点实验室
测试手段先进2004年以来，在国家及省有关部门的资助下，重新购置了包括谷物脂肪-蛋白质自动分析仪、原子光谱分析仪、根系自动扫描仪以及PCR仪等先进仪器设备
科研成果丰硕建所以来，取得获奖成果212项，其中获国家级奖励5项，获得省部级奖励59项，拥有2项国家专利， 5个授权品种，累计创造社会效益200亿元
现有成果年推广面积达2000万亩，年创造社会效益3亿元
大豆育种研究长期处于国内领先水平以先后获得国家科技进步二等奖、黑龙江省政府科技进步一等奖的合丰35号和合丰25号为代表的合丰系列大豆品种，每年种植面积达到1200-1500万亩，全省大豆种植面积占有率达到30-40%，全国春大豆种植面积占有率达到25%
品种占有率连续15年位于全国第一
合丰系列大豆品种已经成为全国知名大豆品牌，种植区域扩大到吉林、辽宁、内蒙古等10多个省区
玉米育种崭露头角新培育的适于黑龙江省二、三积温带种植的合玉19、20、21、22号玉米品种，正在逐步占领适宜生态区
其中，合玉21号、22号获得国家农作物品种权保护，合玉19号、20号玉米生产经营权成功转让
大豆病害研究基础扎实最先在国内系统地开展大豆灰斑病、疫霉病和根腐病研究工作，并成为全省首家大豆灰斑病鉴定中心
国际合作研究卓有成效最先在我国高纬度地区引进和完善美国“半矮秆大豆窄行密植栽培技术”，为我国传统大豆主产区开发新的栽培模式做出了重要贡献
与日本专修大学合作研制出的 “三段式心土混层犁”、 “四段式秸秆心土混合犁”，为改良我国北方地区广泛分布的白浆土、白干土和盐碱土开辟了新的途径，整体研究达到国际先进水平
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