交叉学科国内外发展美国得克萨斯大学教授艾伦·雷普克在《如何进行跨学科研究》一书中谈到，根本原因是大学管理机构缺少对交叉学科的“系统化落实”
“大学往往把交叉学科视为一种趋势，而不是真正的变革，结果就以零碎、缺乏条理、凑合的方式进行跨学科工作，而不是视之为全面、彻头彻尾的改革
”我国跨学科交叉科研机构由于发展时间更短，导致目前在高校内仍存在不少问题
清华大学科研院的一项研究指出，高校促进跨学科交叉的评价机制和考核激励机制尚未完全建立；院系对于鼓励教师跨院系兼职和跨学科交叉研究工作动力不足；资源配置方式的改革仍须进一步探索；教师跨院系兼职管理制度还未能得到广泛应用；交叉学科相关学生培养机制尚未健全；重大项目推进机制仍在形成过程中
在这种现状下，国内要想在复合型人才培养和交叉学科领域取得突破性进展，任重而道远
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