杨焕明荣誉表彰时间荣誉/表彰来源1996年国务院政府特殊津贴2002年美国《科学的美国人》杂志─“2002年世界科学领袖” 2003年日本经济新闻社─“亚洲科技奖” 2003年中国科学技术协会─“全国防治非典型肺炎优秀科技工作者”2004年中国科学院政府特殊津贴2005年日本“蚕丝协会特别奖”2005年第三世界科学院─TWAS生物奖 2006年何梁何利基金“科学与技术进步奖-生命科学奖” 2008年深圳市人民政府“深圳市科技创新奖” 2008年香港中文大学荣誉教授2009年丹麦奥胡斯大学荣誉博士2009年香港中文大学荣誉博士2010年人类基因组组织（HUGO）卓越科学成就奖2010年“深圳经济特区30年杰出创新人物”称号 2012年9月德国国家科学院外籍院士2014年6月18日汤森路透社“2014最具影响力研究人员” 2017年05月全国创新争先奖
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