谷超豪文革期间1965年，到上海县梅陇公社朱行大队参加“四清”运动
1966年6月，文化大革命开始，回校接受批判
1967至1969年，受批判，在校内劳动，曾到横沙岛、宝山县罗店公社徐家宅大队劳动
在农村劳动中，工宣队有些人刁难他，让他干力不能及的事，他还是挣扎着干
农民同情他，把他保护起来
对此，他深为感动
最使谷超豪心疼的是他的科研工作被迫停止
校外有些工程单位多次来复旦，要求谷超豪参加他们的研究工作，先后被回绝
1970至1971年，受批判，分配到复旦大学理科大批判组，查阅、整理数学、物理方面的资料，直到文革结束
1973年，一个研究空间技术的单位直接找到了谷超豪，市里的有关机构也同意他参与此项研究，但又被单位领导否决，谷超豪为此伤心地流泪，后经力争，终于同意他“从旁协助”
当然，在实际工作中他仍然是带头人，使他有幸能把自己掌握的高速空气动力学和混合型方程的知识用到实际问题的研究中去
1976年，文革结束，回到数学研究所
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