金之俊晚年时期顺治十六年（1659年），清廷下诏为崇祯帝立碑，命金之俊撰文
不久加太保兼太子太师，再次请求回乡
顺治十七年（1660年），亲自上书祈求回乡，顺治帝下诏婉言将他召回，金之俊未至，加太傅
顺治十八年（1661年），又改为秘书院大学士
金之俊自归后，屡以衰老乞休，康熙元年（1662年），清廷才准许他致仕
金之俊家居，有为匿名帖榜其门以谤之者，之俊白总督郎廷佐穷治之，牵累不决
事闻，上不直所为，以律禁收审匿名帖，镌廷佐二级，之俊削太傅衔
康熙九年，卒，谥文通
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