起义者在林爽文领导下，于乾隆五十一年（1786年）与清军展开激战，连克数县

清廷命闽浙总督佟佳·常青前往台湾府镇压民变

由于常青镇压不力，农民军声势更加浩大，连常青所在府城都被包围

 乾隆五十二年（1787年）七月，乾隆帝改派福康安为将军，与参赞大臣海兰察共同渡海赴台湾作战

十一月，福康安一行渡鹿仔港（今台湾彰化西南鹿港），登岸后，由新埤进兵，以主力进攻包围诸罗（今台湾嘉义）城的农民军

双方交战至仑仔顶，农民军从竹围中出而抵御，福康安令军队原地不动，自领巴图鲁侍卫冲入起义军中，起义军战败

清军又攻克俾长等十余村庄，起义军被迫撒离诸罗

清兵追至大排竹，决溪水渡兵，焚烧了起义军的营寨

诸罗一战，福康安以扭转战局、解除城围，被封为一等嘉勇公，赏红宝石帽顶，四团龙补服，以示优异

 十二月，清军继续对起义军进行围剿，福康安又统兵由内山搜至打铁寮诸社，分兵堵截海口及各要隘

为防止林爽文见追急自戕，福康安密令巴图鲁侍卫十人及屯练兵数百人，改换装束，深入高山密林，终于在乾隆五十三年（1788年）正月，于老衢崎俘获林爽文

   林爽文起义失败以后，福康安于乾隆五十三年（1788年）二月继续督兵赴南路镇压农民军余部，将农民军追至台湾最南端的郎峤，水陆并发，将南路起义军首领庄大田俘获

至此，台湾的起义军被全部镇压下去

 《平定台湾得胜图》中关于福康安指挥诸役的描绘（图册参考资料 ）平台后，福康安获赐黄腰带、金黄珊瑚朝珠

清廷还命台湾郡城及嘉义（原诸罗）县为福康安建生祠

乾隆帝还在紫光阁绘“平定台湾前二十功臣”图像，福康安位列第四，仅次于大学士阿桂、钮祜禄·和珅、王杰

 乾隆帝再次作诗称赞道：“金川领兵，已著伟名

几处封疆，吏肃政成

解围擒逆，能人不能

崇封殊爵，嘉尔忠诚

” 福康安考察台湾实情，向乾隆帝上疏处理台湾问题善后十六事，认为要解除台湾人民再次起兵的隐患，就需习武事，除奸民，清吏治，肃邮政

乾隆帝一一依从

 乾隆五十三年（1788年）十一月，福康安调任闽浙总督

乾隆五十四年（1789年）正月，因两广总督孙士毅兵败安南，扶植后黎朝的黎维祁不成，乾隆帝遂调福康安为两广总督，负责处理安南事务

二月，福康安抵达兴化府，提出了以军事威慑逼使西山朝的阮惠畏威、款关投降的策略，乾隆帝大表赞同

三月，福康安驰抵镇南关

经阮惠多次请降，清廷最终决定罢兵允和

  不过在这段时间，和珅之弟、巡漕御史钮祜禄·和琳参奏湖北按察使李天培，用湖广粮船私运木材，由此讯得福康安捎信索购一事，乾隆严旨令福康安自劾，罚其三年的总督养廉银，加罚公俸十年，革职留任，但马上即减免

以上内容由大学时代综合整理自互联网，实际情况请以官方资料为准。