中国昆虫学会机构设置最高权力机构学会的最高权力机构是全国会员代表大会，全国会员代表大会职权是：（一）制定和修改章程；（二）选举和罢免理事；（三）审议理事会的工作报告和财务报告；（四）决定终止事宜；（五）举行学术活动；（六）决定其他重大事宜

执行机构理事会是全国会员代表大会的执行机构，在闭会期间领导学会开展日常工作，对全国会员代表大会负责

理事会的职权是：（一）执行全国会员代表大会的决议；（二）选举和罢免理事长、副理事长、秘书长；（三）筹备召开全国会员代表大会；（四）向全国会员代表大会报告工作和财务状况；（五）决定会员的吸收或除名；（六）决定设立办事机构、分支机构、代表机构和实体机构；（七）决定副秘书长、各机构主要负责人的聘任；（八）领导学会各机构开展工作；（九）制定内部管理制度；（十）筹措和分配活动经费并监督其使用情况；（十一）进行奖励和表彰活动；（十二）举行学术活动

 办事机构据2018年5月学会官网显示，学会设有5个工作委员会、14个专业委员会

 工作委员会：科学普及、科技咨询、国际学术交流、组织、青年、出版专业委员会：昆虫分类区系、昆虫生理生化与分子生物学、昆虫生态、药剂毒理、农业昆虫、林业昆虫、医学昆虫、生物防治、资源昆虫、城市昆虫、蜱螨、蝴蝶、外来物种及检疫、古昆虫 

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