青海湖国家级自然保护区机构设置管理局2008年7月干部职工33人，内设办公室、科研保护科、信息宣传科、森林派出所等机构，另建立鸟岛、泉湾、黑马河、湖东、甘子河5个保护管理站
2007年体制改革，并入青海湖景区保护利用管理局的领导，成为其自然资源与环境保护处
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