海洋细菌生态作用在海洋生态系中的作用海洋经历着剧烈的变动而又不断地保持着动态平衡,始终富有生命力和生产力，海洋细菌在其中起着重要的作用

当海洋生态系的动态平衡遭受某种破坏时，海洋细菌以其敏感的适应能力和极快的繁殖速度，迅速形成异常微生物区系，积极参与氧化、还原活动，调整和促进新动态平衡的形成和发展

在海洋氮循环中的作用海洋氮循环的基本途径与陆地相仿,至今尚未从海洋中直接分离得到根瘤菌，但通过定量PCR方法发现地中海腐殖泥中有大量放射型根瘤菌(Rhizobium radiobacter)

固氮菌可以从海洋中分离到，硝化细菌多集中分布于海洋沉积物中

在海水中，硝酸盐的含量随着靠近海底沉积物的距离而逐渐增加，因此硝化作用在大陆架和近岸海域较为明显，海洋中的硝酸盐主要是通过这一途径产生

反硝化作用在有机物来源丰富、溶解氧浓度低的内湾和河口海域较为强烈，反硝化细菌在一定条件下影响海洋中可利用状态的氮

在海洋硫循环中的作用某些异养细菌分解含硫蛋白类物质时产生硫化氢；在有机物丰富的浅海嫌气水域，硫酸盐还原细菌还原硫酸盐时，也产生大量硫化氢，污染大片海湾与滩涂

这些硫化氢可由各种硫细菌逐步氧化，最终形成硫酸盐

在海洋磷循环中的作用细菌分解海洋动植物残体，并释放出可供植物利用的无机态磷酸盐

磷也是海洋微生物繁殖和分解有机物过程所必需的因子

在海洋食物链中的作用海洋细菌多数是分解者，有一部分是生产者，因而具有双重性，参与海洋物质分解和转化的全过程

在嫌气条件下，有机物质分解的最终产物是甲烷和硫化氢等;在多氧条件下，有机物质的分解是不完全的

在海洋中，分解有机物的代表性菌群是随着被作用有机物的类别而不同的：分解有机含氮化合物者，分别有液化明胶、消化鱼蛋白、蛋白胨多肽、氨基酸、含硫蛋白以及分解尿素等细菌；分解碳水化合物者，分别有分解各种糖类、淀粉、纤维素、琼胶、褐藻酸以及甲壳素等细菌

另有降解烃类化合物以及利用芳香化合物（如酚等）的细菌

海洋细菌分解有机物质的终极产物，如氨、硝酸盐、磷酸盐以及二氧化碳等，都直接或间接地为海洋植物提供营养

可见，它们在海洋无机营养再生过程中起着重要的作用

海洋细菌自身增殖的生物量，也为海洋原生动物、浮游动物以及底栖动物等提供直接的营养

除异养细菌外，某些海洋细菌具有光合作用的能力

另一类海洋化能自养的细菌，从氧化氨、硝酸盐、甲烷、分子氢和硫化氢等中，取得能量而增殖

如在海底热泉的特殊生态系中，硫磺细菌是利用硫化氢作为能源而进行有机碳的初级生产

由于深海是非光合作用区，其生物区系的构成有其独特性，因此细菌在深海生态系食物链中的作用，已引起重视

在海洋动物植物体表和动物消化道内，存在着特异的微生物区系，如孤菌等是海洋动物消化道中常见的细菌；分解甲壳素的细菌也能在肉食性动物消化道中发现；利用各种多糖类的细菌常是海藻体表的重要菌群，如褐藻酸降解菌是海带上的优势菌群

细菌的中间代谢产物，如抗菌素、氨基酸、维生素和毒素等，是促进或限制某种海洋生物生存和生长的因素

某些浮游生物与细菌之间存在着相互依存的营养关系，如细菌为浮游植物提供必需的维生素等营养物质，浮游植物分泌乙醇酸等物质为某些细菌提供能源和碳源

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