肇庆医学高等专科学校院系设置截至2020年12月，学校有直属附属医院3所：肇庆医专第一附属医院（肇庆市第一人民医院）、肇庆医专第二附属医院(肇庆市第二人民医院)、肇庆医专第三附属医院（肇庆市口腔医院），非直属附属医院3所，设有8个教学系部，开设15个专科专业
专业设置系（部）专业名称临床医学系健康大数据管理与服务、临床医学、健康管理医学技术系放射治疗技术、医学检验技术、医学影像技术、预防医学护理系护理、助产、智慧健康养老服务与管理中医系中医学、针灸推拿、中医骨伤、康复治疗技术、中医康复技术口腔医学系口腔医学技术、口腔医学药学系药品经营与管理、中药学、药学
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