皖南医学院研究成果2016年，学校获国家自然科学基金资助项目14项，其中获面上项目5项，青年科学基金项目7项，应急管理项目2个，总资助直接经费385.5万元

 2018年，学校全年获批校外各级各类纵向科研项目91项，其中国家自然科学基金10项、教育部人文社会科学研究项目1项，年度获批纵向科研经费首次突破1000万元；横向合作开创新局面，新签订横向科研项目合作协议4项，协议经费635.9万元；获2018年度安徽省科技进步奖二等奖3项；SPF动物实验室通过验收，结束学校无《实验动物使用许可证》的历史

 2019年，学校一附院黄后宝教授主持的《类器官诱导的肿瘤反应性 T 细胞治疗去势抵抗性前列腺癌的前瞻性单臂临床研究》获批安徽省科技重大专项计划项目

皖南医学院安徽省科学技术奖获奖项目（部分）项目名称获奖级别年度重症肌无力围术期处理策略的建立与临床应用安徽省科技进步二等奖2016年度优质特色皖南黑猪新品系选育及配套组装技术示范与推广安徽省科技进步三等奖2016年度血浆蛋白C活性特异性诊断试剂的研究安徽省科技进步三等奖2016年度 腹腔镜胰十二指肠切除术的关键技术与临床应用安徽省科技进步二等奖2018年度围术期应激反应的调控策略与临床应用安徽省科技进步二等奖2018年度国医大师李济仁治痹思想的传承与创新安徽省科技进步二等奖2018年度 

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