中国药科大学科研机构根据2020年5月学校官网显示，学校有国家重点实验室和省部级重点实验室、工程技术中心以及创新平台30个，其中4个教育部“111”引智基地，2个省级协同创新中心，国家自然科学基金创新研究群体1个，教育部创新团队2个

 国家级及省部级科研平台国家重点实验室天然药物活性组分与药效国家重点实验室国家部委科研平台国家新药筛选中心药物质量与安全预警教育部重点实验室科技部临床前药代动力学关键技术平台新药安全评价研究中心中药复方药代动力学方法重点研究室国家中药材加工技术研发专业中心智能制药关键技术教育部工程研究中心江苏省科技厅重点实验室江苏省药物代谢动力学重点实验室江苏省纳米药物制备与生物学评价公共技术服务中心江苏省新药筛选中心江苏省药物分子设计与成药性优化重点实验室江苏省药效评价与服务中心江苏省协同创新中心生物医药协同创新中心现代中药协同创新中心江苏省教育厅重点实验室江苏省肿瘤发生与干预重点实验室江苏省中药评价与转化创新重点实验室江苏省新药创制与产业化技术服务示范平台生物药物成药性研究江苏省高校重点实验室江苏省抗代谢性疾病药物重点实验室天然活性物质发现与研究江苏省高校重点实验室部校共建科研平台禁毒关键技术联合实验室国家药物政策与医药产业经济研究中心其他科研平台江苏省合成多肽药物发现与评价工程研究中心江苏省新型神经药物制剂技术中心江苏省半合成抗生素研究中心医药科技创新支撑服务平台 省部级重点科研团体国家自然科学基金创新研究群体科学基金中药活性成分群发现与作用机理教育部创新团队符合中医药特点的中药复杂体系药效物质基础与质量控制研究天然药物分子发现与结构优化（滚动）天然药物分子发现与结构优化江苏省双创团队基于“药物再发现”策略的药物创新研究环肽和含氮化合物的创新药物研究新药创新的化学生物学和个体化医学的转化研究系统解析cGAS-STING细胞信号转导通路在相关重大疾病中的新功能与调节机理及小分子先导化合物的研发缓释制剂关键技术及创新药物研发江苏省教育厅科技创新团队药物代谢动力学创新研究以天然产物为先导的抗肿瘤创新药物中成药评价与再创新研究蛋白质命运与新药发现关键技术创新团队多糖类药物研发关键技术天然产物创新药物研究个体化治疗药物研究 

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