南京中医药大学科研平台截止2014年6月，学校建有2个江苏高校协同创新中心、1个省部共建重点实验室、1个科技部国家中药临床试验研究（GCP）中心、1个教育部工程研究中心、1个江苏省中医药研究与新药创制中心、3个国家中医药管理局重点研究室、5个江苏省（高校）重点实验室、8个国家中医药管理局三级实验室、5个省级工程研究中心（工程实验室）、2个市级工程技术研究中心、2个校级重点实验室和1个SPF级实验动物中心

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