上海海洋大学学术资源馆藏资源截至2017年5月，上海海洋大学图书馆有纸质图书140万余册，电子图书约98册，数据库40余个，馆藏资源突出学校的海洋、水产、食品特色

学术期刊《上海海洋大学学报》（原《上海水产大学学报》）是由上海市教委主管、上海海洋大学主办，以水产科学技术为主的综合性学术期刊

《上海海洋大学学报》作为文献源被《化学文献》（CA）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ,VINITI）、日本《CBST 科学技术文献速报》、《日本科学技术振兴机构中国文献数据库》、《水科学和渔业文摘》（ASFA）、《中国科学引文数据库（CSCD）》、《中国生物学文摘》、《中国水产文摘》等众多国内外检索期刊收录

《上海海洋大学学报》被北京大学图书馆定为“中文核心期刊”、被中国科学院文献情报中心定为“中国科学引文数据库来源期刊”、被中国科学技术信息研究所定为“中国科技核心期刊”

2006年，《上海海洋大学学报》荣获教育部科学技术司颁发的“首届中国高校优秀期刊奖”，2013年获得教育部科技发展中心颁发的2012年度“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖

 《水产学报》是由中国科协主管、中国水产学会主办、上海海洋大学承办的以反映我国水产科学技术成果为主的学术类核心期刊（中国科学引文数据库CSCD核心库和中国科学技术信息研究所核心库）

《水产学报》已加入了中文期刊全文数据库、中国学术期刊综合评价数据库、中国生物学文献数据库、清华大学（光盘版）电子刊物数据库、万方数据网络中心

《水产学报》作为文献源被美国《化学文摘》（CA,Chemical Abstracts）、俄罗斯《文摘杂志》（AJ,VINITI）、英国《农业与生物科学研究中心文摘》（CAB Abstracts）、英国《全球健康》（Global Health）、美国《剑桥科学文摘》CSA（NS）、《日本科学技术振兴机构中国文献数据库》（JST）、英国《动物学记录》（ZR，Zoological Record）、美国《乌利希期刊指南》（UPD，Ulrich's Periodicals Directory）、《水科学和渔业文摘》（ASFA）、《中国科学引文索引》、《中国学术期刊文摘（中、英文版）》、《中国生物学文摘》、《中国水产文摘》等众多国内外检索期刊收录

《水产学报》 为2002-2009年，2011年“百种中国杰出学术期刊”；2008年及2011年科技部“中国精品期刊”；2009年，2012年“华东地区优秀期刊”；2006年-2008年获中国科协“精品期刊工程项目（C类）”资助；2009-2011年获中国科协“精品期刊工程项目（B类）”资助；2012-2013年获中国科协“期刊学术质量提升项目”资助

2012年被评为“中国国际影响力优秀学术期刊”和RCCSE“中国权威学术期刊”

 学校还主办中国第一本水产类英文期刊《Aquaculture and Fisheries》

学校是上海市水产学会、上海市食品学会、上海市渔业经济研究会和上海市延安精神研究会挂靠单位

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