中国科学院生态环境研究中心学术期刊《生态学报》《生态学报》是由中国科学技术协会主管，中国生态学学会、中国科学院生态环境研究中心主办的生态学高级专业学术期刊，半月刊，创刊于1981年
主要报道生态学重要基础理论和应用研究的原始创新性科研成果
所刊文章类型有:研究综述;研究论文;学术信息与动态;生态学新理论、新方法、新技术介绍;新书评介及开放实验室介绍等
《环境科学学报》《环境科学学报》于1981年创刊，月刊，由中国科学院生态环境研究中心主办，科学出版社出版
主要报道环境化学、环境地学、环境毒理与风险评价、环境修复技术与原理、环境污染治理技术原理与工艺、环境经济与环境管理等
被收录为国家科技部“中国科技论文统计源期刊”（中国科技核心期刊）、“中国学术期刊综合评价数据库”统计刊源，被“中国期刊全文数据库”、《中国生物学文摘》、“中国生物学文献数据库”、“中文科技期刊数据库”、美国《Chemical Abstracts》（《化学文摘》）、联合国《Aquatic Sciences and Fisheries Abstracts》(水科学和渔业文摘)等收录
《环境科学》《环境科学》由中国科学院主管，中国科学院生态环境研究中心主办，创刊于1976年，为月刊，入选中共中央宣传部、新闻出版总署和科学技术部的“中国期刊方阵”，并得到中国科学院科学出版基金的资助
被工程索引Ei；美国医学索引MEDLINE；美国化学文摘CA；俄罗斯文摘杂志AJ；美国生物学文摘预评BP；美国医学索引IM；日本科学技术情报中心数据库JICST；英国动物学记录ZR；剑桥科学文摘（CSA）：Environmental Sciences；剑桥科学文摘（CSA）：Pollution Abstracts；剑桥科学文摘（CSA）：Life Sciences Abstracts等；国内的检索系统有中国科技论文统计与引文数据库（CSTPCD）；中文科技期刊数据库（维普）；中国期刊全文数据库（CNKI）；数字化期刊全文数据库（万方）；中国科学引文数据库(CSCD)；中国生物学文摘等收录
《环境工程学报》《环境工程学报》是由中国科学院主管、中国科学院生态环境研究中心主办的环境工程类学术期刊（月刊），1980年创刊
被日本科学技术振兴机构数据库（JST）、荷兰爱思唯尔（Elsevier）公司的Scopus全学科引文文摘数据库、中国科技论文统计与引文数据库（CSTPCD）、中国期刊全文数据库（CJFD）以及中国科学引文数据库（CSCD）等收录
《环境化学》《环境化学》是中国科学院生态环境研究中心主办的学术性刊物，为中文核心期刊，1982年创刊
被美国的《化学文摘》、《中国化学文摘》、《中国化工文摘》、《中国环境科学文摘》、《中国医学文摘（卫生学分册）》、《中国科技论文与引文数据库》和《中国科学引文数据库》、《中文科技期刊数据库》、“万方数据－数字化期刊群”等收录
《生态毒理学报》《生态毒理学报》由中国科学院生态环境研究中心主办，于2006年创刊
被《中文核心期刊要目总览》（中文核心期刊）；《中国科技论文统计源期刊》（中国科技核心期刊, CSTPCD）；中国科学引文数据库(CSCD)；中国期刊全文数据库（CJFD）；《中国学术期刊文摘》；美国化学会的化学文摘（Chemical Abstracts）；美国生物学文摘（Biological Abstracts）；美国生物学文摘预评（BIOSIS Previews）；美国乌利希国际期刊指南（Ulrich's Periodicals Directory）；英国动物学记录（Zoological Record）等检索机构收录
《环境科学学报（英文版）》《环境科学学报（英文版）》创刊于1989年，由中国科学院生态环境科学研究中心主办，由埃尔塞维尔出版社和科学出版社联合出版，发表关于新出现的污染物的命运和行为、人类对环境的影响、人类接触环境污染物及其对健康的影响以及环境补救和管理的重要而新颖的研究
被SCI、EI、CC(ISI)、CA(美国)、PA(美国)、BIOIS(美国)、BA(美国)、联邦自然保护署(德国)、NAL系列(美国)、ASTA(美国)、IRSD(日本)、WCS of EST(列支敦士登)、Geo文摘(英国)和中国科学与技术索引期刊摘要(中国)等收录
《生态系统健康与持续性》（英文）《生态系统健康与持续性》创刊于2015年，是由美国生态学会和中国生态学会共同出版的全球生态期刊
自2017年5月起，中国科学院生态环境科学研究中心参与出版
期刊主要发表关于生态学和可持续性科学的进展、全球环境变化如何影响生态系统健康、人类活动的变化如何影响生态系统状况以及将生态科学应用于决策以促进可持续发展的基于系统的方法
期刊被DOAJ、Zoological Record、BIOSIS Previews、Science Citation Index Expanded、Scopus等收录
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