中国科学院电子学研究所科研部门截至2014年7月，电子所下设11个研究部门，包括微波成像技术重点实验室、传感技术国家重点实验室（北方基地）、高功率微波源与技术院重点实验室、电磁辐射与探测技术院重点实验室、空间信息与应用系统技术院重点实验室（地理与赛博空间信息技术实验室、信息处理与图像分析实验室）、空间行波管研究发展中心、高功率气体激光技术部、航天微波遥感系统部、航空微波遥感系统部和可编程芯片与系统研究室
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