中国科学院上海巴斯德研究所人员编制截至2017年底，上海巴斯德所共有在职职工112人
其中科技人员71人、科技支撑人员16人，包括研究员及正高级工程技术人员29人、副研究员及高级工程技术及高级实验师人员19人，其中外籍研究员4人
共有国家杰出青年科学基金获得者4人，中国科学院“百人计划”18人，中国科学院“特聘研究员”3人，“973”首席科学家1人，国家外国专家局“外专高端计划”1人，上海外国专家局引进境外技术、管理人才项目2人，上海外国专家局引进境外技术、管理人才项目1人，国家“新世纪百千万人才工程”1人，中国科学院“青年创新促进会优秀会员”1人，中国科学院“青年创新促进会会员”7人，中国科学院交叉与合作团队2支
项目名称人员名单国家杰出青年科学基金获得者唐宏、孙兵、蓝柯、李斌中国科学院“百人计划”孙兵、唐宏、蓝柯、钟劲、李斌、孟广勋、黄忠、肖晖、苏枭、江陆斌、梁小珍、陈昌斌、冷启彬、王建华、张岩、周东明、钱志康、龙钢 国家“新世纪百千万人才工程”蓝柯
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