中国科学院上海高等研究院所获荣誉2020年12月，入选2019-2020年节约型公共机构示范单位名单
2022年1月30日，入选2021-2025年全国科普教育基地第一批拟认定公示名单
2022年5月，中国科学院上海高等研究院软X射线自由电子激光攻关青年团队被授予第26届中国青年五四奖章
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