中国医学科学院药物研究所学科建设根据2019年3月研究所官网显示，中国中医科学院药物研究所有国家重点一级学科1个，有学术学位授权二级学科硕士点5个、专业学位二级学科硕士点1个及学术学位授权二级学科博士点6个
此外还设有1个博士后科研流动站
国家重点一级学科（1个）：药学 学术学位授权二级学科博士点（6个）：药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、微生物与生化药学、药理学 学术学位授权二级学科硕士点（5个）：药物化学、药剂学、生药学、药物分析学、药理学专业学位二级学科硕士点（1个）：药学 博士后科研流动站（1个）：中国医学科学院药物研究所博士后流动站
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