中国农业科学院蔬菜花卉研究所改革开放1980年，蔬菜所迁至中国农业科学院东门外

1981年6月，研究所职工发展至182人

1987年12月，增加达240人

 1981年，研究所开始招收蔬菜学专业硕士研究生

 1984年，研究所获得硕士学位授予权

 1987年12月3日，根据国家科委（87）国科发综字0806号，农牧渔业部（1987）农（人）农函字第17号批文《关于同意中国农业科学院蔬菜所更名的复函》，中国农业科学院蔬菜研究所更名为中国农业科学院蔬菜花卉研究所，原隶属关系不变，除承担原有蔬菜研究任务外，还承担花卉研究工作

1995年，研究所开始招收博士研究生

 1996年，研究所获得博士学位授予权

 1997年12月，全所职工为223人

 2001年，研究所对研究室的设置进行了调整，按学科分为：生物技术研究室、种质资源研究室、十字花科育种研究室、茄科育种研究室、葫芦科育种研究室、栽培与采后技术研究室、植物保护研究室、花卉研究室

2003年10月，研究所对管理及服务机构进行了整合，调整后的机构设置为：科研处、综合处、财务处和服务中心

同年，研究所被批准为园艺学博士后流动站

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