中国农业科学院农产品加工研究所国际合作截至2019年10月，承担联合国食农组织（FAO）食品科学参考实验室筹建工作，并作为FAO南南合作中国伙伴整体进入Gateway平台，向全世界开放研究所资源和专家信息，代表FAO承担指导农产品加工技术研究、开发、技术转移与培训、青年学者交流、技术示范等相关工作任务
代表中国政府承建了“中国-阿根廷食品科学技术中心”、“中国-以色列农业联合研究中心”
目前研究所与美、德、法、意、澳、加等国家国际一流科研院所签署国际合作协议66份，建立国际合作平台22个，通过人员交流、研究生联合培养、共同申请国际合作项目和共同举办国际会议等方式不断夯实国际合作平台建设
截至2015年3月，农产品加工研究所共承担科技部对发展中国家援助项目“中国-阿根食品科学技术中心”、“肉品质量与安全及溯源技术”，科技部国际合作专项“植物蛋白加工与利用技术”、“农副产品中功能成分制备关键技术合作”，科技部港澳台项目“中式肉制品工业化加工与危害物控制”，农业部948项目“农产品加工副产物高值化利用技术引进与利用”，国家外专局高端外专项目“食品及饲料中多种真菌毒素的快速增强检测分析方法研究”等国际合作项目近20项，经费达2000万元
截至2015年3月，近两年来，农产品加工研究所共举办了2014国际真菌毒素大会、中-阿食品科学技术中心研讨会、中-欧农产品加工技术交流研讨会等大型国际会议8次
创新工程启动以来，农产品加工研究所先后聘请美国、加拿大、德国、法国等食品科学领域院士、知名学者8人为研究所特聘研究员，与国内特聘专家一起组成创新工程咨询专家组
2013-2014年，农产品加工研究所通过国家留学基金委、国际组织等渠道共派出青年科研人员10人赴国外一流科研院所和高校进修
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