中国农业科学院农业经济与发展研究所科研部门截至2011年1月，中国农业科学院农业经济与发展研究所有国家级实验室1个，此外研究所还设有农业政策、农业技术经济、畜牧经济、贫困与发展、资源与环境、农产品流通与国际贸易、食物安全与营养7个研究室及企业经济、区域经济、数字化、海峡两岸农业发展4个研究中心
国家级实验室（1个）：国家农业政策分析与决策支持系统开放实验室
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