中国医学科学院医学实验动物研究所科研项目2016年，研究所共申报科研项目71项，获批35项，人类疾病动物模型平台项目，获得国家医学与健康创新工程项目资助，建设国家级的疾病动物模型资源平台
《重大传染病动物模型资源库的建立及应用》获教育部科技奖二等奖
2017年，研究所在研纵向项目共计102项（包括参与外单位项目），获得科研项目经费达到1.5亿左右
其中2017年立项以及中标项目共计32项（包括参与外单位项目），主要包括：科技部重大专项3项，科技部国家重点研发计划4项，国家自然科学基金11项等
2018年，研究所在研的纵向项目共计92项（包括参与外单位项目），获得的科研项目经费达到5500万元左右
其中2018年中标的项目共计21项
研究所《人类重大传染病动物模型体系的建立及应用》获中华医学会二等奖；《基于CRISPR-Cas9的大鼠精确基因技术体系的建立及应用》获得中国实验动物学会一等奖、北京市科学技术奖
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