中国医学科学院医药生物技术研究所科研成果“十一五”、“十二五”期间，药生所主持开展并完成了众多“新药创制”重大科技专项、自然科学基金、“863”、“973”等国家科技计划项目

承担和实施国家“十三五”医药卫生领域的各类科技计划项目100多项

还主持了多项国际重大项目，包括：美国NIH/比尔盖茨基金会“全球重大卫生挑战计划”项目，中加抗HIV药物重大国际合作项目，中瑞抗菌药物重大国际合作项目

截至2018年，药生所已发表SCI文章700余篇，其中药学相关文章580余篇，基础研究相关文章60余篇，交叉学科文章百余篇

IF在5以上的SCI论文达50余篇（包括Nature Medicine, Cancer Cell, Cancer Research, Autophagy, Autophagy, Hepatology, PNAS等）

获得国家发明专利授权230余项

共有100多项科技成果获国家发明奖、国家科技进步奖、国家自然科学奖、全国科学大会成果奖、全国医药卫生科学大会成果奖、中华医学科技奖、卫生部科技进步奖、各省市级奖励等；获得新药证书30余项 

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