中国医学科学院病原生物学研究所领导班子所长：金奇研究员
主持研究所全面工作，分管所务办公室、财务处、人力资源处、新址基建办公室及相关工作
副所长：王健伟研究员
分管科技教育处、实验室管理处及相关工作
副书记：刘海鹰副研究员
主持党务工作，分管党群办公室、行政后勤管理处及相关工作
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