行政院直属其他机构行政院除各部、会、署外，尚有许多院的直属机构，废置也无定制，择其要者有:中央古物保管委员会、国立北平故宫博物院、旧都文物整理委员会、管理庚款董事会、中央图书杂志审查委员会、液体燃料管理委员会、水陆运输联合委员会、全国粮食管理局、敌产处理委员会、技术合作委员会、行政效率研究会、国民经济设计委员会、县政计划委员会、川康经济建设委员会、重庆陪都建设计划委员会、敌人罪行调查委员会、全国财政委员会、整理内外债委员会、全国稻麦改进监理委员会、审核委员会、建设事业审核委员会、战时公债劝募委员会等
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