尊经书院宋育仁光绪二十四年（1898年），翰林院检讨、曾任驻英、法、意公使衔参赞的宋育仁接任书院山长
宋氏本是尊经书院毕业的学生，也是近代著名的维新派人士
他在书院组织了维新团体“蜀学会”，发行《蜀学报》，以著名学者吴之英为主笔，廖平为总纂，对戊戌变法在四川的推行起到了不可磨灭的作用
“蜀学会”的宗旨是“发扬圣道，讲求实学”，带有浓厚的“中体西用”色彩，与尊经书院的宗旨一脉相承，也是尊经书院影响近代四川社会的一个重要表现，值得一提的是，为了方便刻版印书，尊经书院还开设了尊经书局，这在当时的国内各书院中，实属佼佼者
1892年，近代著名的维新思想家唐才常从湖南长沙来到成都，虽然发现当时四川的文风，尚离锐意革新的湖南有差距，仍不忘称赞：“四川尊经书院书籍甚好”
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