机械总院集团云南省机械研究设计院科研部门根据2021年10月云南院官网显示，机械总院集团云南省机械研究设计院下设5个行政部门及多个院属科研部门，此外，设有云南省院士工作站；云南省机械工程学会等行业机构设在云南院
国家级科研机构：云南省机械设备产品质量监督检验站·国际ilac MRA CNAS认可实验室、国家技术转移示范机构省部级科研机构：国家工信部两化融合管理体系贯标咨询服务机构、国家工信部服务型制造示范平台、机械工业机床产品质量检测中心(昆明)、云南省机械设备产品质量监督检验站、云南省机电一体化应用技术重点实验室、云南省先进制造技术研究中心、云南省机械设备产品质量控制和技术评价实验室、云南省装备制造业生产力促进中心、云南省工业机器人应用工程技术研究中心、云南省机械科技情报所 院属科研机构：机电技术所、智能技术所、检测分中心、信息技术所、战略咨询所、建筑设计所
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