那不勒斯国家考古博物馆建筑布局一楼，主要展示雕像、石棺等
二楼，除了依年代展示许多湿壁画之外，还有珍贵的玻璃皿、珠宝饰品等
三楼，大部分来自庞贝城的，其中包括对马其顿帝国(Macedonian)最著名的描述《亚力山大战役》(Battle of Alexander)
展示精美的镶嵌画《亚历山大大帝大战波斯皇帝大流士》，是一系列细致描述动物、日常生活、音乐家甚至柏拉图和他的学生对答的画像
地下室，是陈列埃及美术工艺品的展示区
密室，数十年来只有重要的研究人员才能进入的密室（Gabinetto Segreto），只是最近才开放给公参观
密室展示了各种各样性爱的雕像，其中一个是牧羊神对一只母山羊不怀好意的雕像，还有9幅描述性爱姿势的油画，嫖客曾把它们当成选择性服务时的参考资料
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