中国海洋湖沼学会学会宗旨认真贯彻中国共产党的基本路线，遵守宪法、法律、法规和国家政策，遵守社会和科学道德风尚
贯彻民主办会精神，团结和动员海洋湖沼科技工作者以经济建设为中心，坚持科学技术是第一生产力的思想，实施科教兴国战略、人才强国战略和可持续发展战略，坚持“百花齐放、百家争鸣”方针，充分发扬民主，开展学术上的自由讨论
提倡辩证唯物主义，坚持实事求是的科学态度和优良学风，弘扬“尊重知识，尊重人才”的风尚
倡导献身、创新、求实、协作的精神，团结广大海洋湖沼科技工作者，促进海洋湖沼科学技术的繁荣和发展，促进海洋湖沼科学技术的普及和推广，促进海洋湖沼科学技术人才的成长和提高，促进海洋湖沼科学技术与经济的结合，为社会主义物质文明和精神文明建设服务，建设创新型国家，高举爱国主义旗帜，维护民族团结，促进祖国统一，为加快实现中国社会主义现代化，建设有中国特色社会的主义做出贡献
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