安徽医科大学研究机构截至2019年7月，学校建有1个科技部省部共建国家重点实验室培育基地，3个教育部重点实验室，1个国家卫生健康委员会重点实验室，32个省部级实验室；有1个教育部科技创新团队，2个安徽省科技创新团队，3个安徽省“115”产业创新团队，3个安徽省高校科研创新平台团队，1个安徽省高校智库；是国家药品临床研究基地 

截至2014年4月，学校建有临床药理、皮肤病、卫生事业管理等65个省、校级研究所，13个中央（财政部）与地方共建实验室

科技部省部共建国家重点实验室培育基地：皮肤病学教育部重点实验室国家卫生健康委员会重点实验室：国家卫生健康委配子及生殖道异常研究重点实验室省部共建重点实验室：省部共建教育部重要遗传病基因资源利用重点实验室教育部重点实验室：皮肤病学教育部重点实验室、抗炎免疫药物教育部重点实验室省级（重点）实验室：安徽省基因研究重点实验室、安徽省分子医学重点实验室、安徽省中药研究与开发重点实验室、抗炎免疫药理学安徽省重点实验室、安徽省重要遗传病基因资源利用重点实验室、人口健康与优生安徽省重点实验室、安徽省人群健康与重大疾病筛查和诊断重点实验室、安徽省天然药物活性研究重点实验、口腔疾病研究安徽省重点实验室、消化疾病安徽高校省级重点实验室、病原生物学安徽省重点实验室、老年病分子医学安徽省重点实验室、安徽省内分泌代谢病省级实验室、重大自身免疫性疾病安徽省重点实验室、生殖健康与遗传安徽省重点实验室、认知与神经精神疾病安徽省重点实验室、泌尿生殖系统疾病安徽省重点实验室、人畜共患病安徽高校省级重点实验室、抗炎免疫药理学安徽省重点实验室、环境毒理学安徽高校省级重点实验室、麻醉与围术期医学安徽高校省级重点实验室等国家中医药管理局中医药科研三级实验室：国家中医药管理局中药药理实验室、国家中医药管理局中药药理（抗炎免疫）实验室、国家中医药管理局中药药理（心脑血管）实验室、国家中医药管理局中药化学实验室安徽省工程技术研究中心：抗炎免疫药物安徽省工程技术研究中心、天然药物活性成分安徽省工程技术研究中心、生命资源保存与人工器官安徽省工程技术研究中心安徽省科技公共服务平台：安徽省生物医学基础与应用科技公共服务平台、安徽省临床检测技术公共服务平台、安徽省新药安全评价中心安徽省国际科技合作基地：安徽省护理学国际联合研究中心安徽省高等校人文社会科学重点研究基地：安徽医科大学医学人文研究中心安徽省2011协同创新中心：安徽省疑难重症皮肤病协同创新中心、安徽省神经精神疾病与心理健康协同创新中心、安徽省抗炎免疫药物协同创新中心安徽省高校产业共性技术研究院：安徽省创新药物研究院安徽省高校智库：安徽省健康发展战略研究中心省级研究院：安徽省转化医学研究院 直属科研单位：安徽医科大学临床药理研究所、安徽医科大学皮肤病研究所、安徽医科大学卫生事业管理研究所、安徽医科大学科研实验中心、安徽医科大学实验动物中心、安徽医科大学高等医学教育研究所等参考资料：         

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