中国科学院地质与地球物理研究所汇川鸣盛1999年，原中国科学院地质研究所与地球物理研究所整合，成立中国科学院地质与地球物理研究所
2004年，将中国科学院武汉数学物理研究所的电离层研究室整体调整到所
2004年，整合原中国科学院兰州地质所，成立中国科学院地质与地球物理研究所兰州油气资源研究中心
2005年，岩石圈演化国家重点实验室建立
2009年，获中组部授予“海外高层次人才创新创业基地”
2014年，获科技部授予“创新人才培养示范基地”；同年，研究所实施中国科学院“率先行动”计划，与中国科学院广州地球化学研究所和中国科学院地球化学研究所共同筹建“中国科学院地球科学研究院”
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